1947年，白崇禧受蒋介石委派，前往台湾处理二二八事件。到达台北后，他立即下令免除所有参与事变者的追责（仅限于非共产党人员），这一命令迅速阻止了即将进行的处决。他利用飞机撒传单，告知岛上居民宽容处理的决定。短短十六天内，白崇禧东奔西跑，从基隆到屏东，努力通过演讲和广播向民众传达安抚信息。

白崇禧特别对外省公教人员表达，希望他们留下来为台湾发展贡献力量，并保证不会再有类似事件。对于潜藏的台籍人士，他也通过广播鼓励他们回家，承诺照顾其安全。然而，另一边的陈仪依然秘密执行处决。白崇禧于3月28日召开会议，严厉斥责了警备总司令部参谋长柯远芬的极端言论，强调不能滥杀无辜。

尽管白崇禧在台湾的权力受到限制，需要向蒋介石汇报请求指示，但他依然不遗余力地制止屠杀，并提出台湾治理的改革建议，包括设立省政府、任用本地人才和推行土地改革。他认为，必须从根本上调整人事制度、改善治理方式，而不能只解决眼前的问题。 赏金女王

返回南京后，白崇禧建议蒋介石更换陈仪并追查柯远芬，但他的声望反而引起了蒋的猜忌。蒋介石对他的态度充满防范，很多建议并未得到采纳。官方的历史记载中，白崇禧的贡献常被淡化或忽视。白先勇在阅读蒋介石日记后发现，蒋对父亲的怀疑日益加深。

1949年后，白崇禧在台湾持续受到监视，失去实权，关于他善后工作的记载模糊不清。即便如此，后来白先勇在访问台湾时发现，许多当地人仍对父亲在那时的举动心存感激，认为如果不是白崇禧的努力，局势将更加严峻。最终，白崇禧在台湾的孤独离世，成为他与台湾历史交织中的一段遗憾。